少年三国志2当中仅支持主公主角调整性别，上阵的三国武将无法修改原本的人物性别，武将立绘、人设与性别绑定，不存在幻化武将性别的相关入口。性别调整只面向自建的主公角色，武将阵营里的关羽、张飞、貂蝉等名将都维持固定性别设定，外观皮肤也不会改变人物基础性别标签，武将的外观换装只会更换服饰与特效，不会切换性别。主公完成性别切换之后，养成属性、神兵养成、穿戴的时装、兵符搭配全部完整保留，不会出现战力下滑或者养成进度清零的情况，只有角色模型、对局语音以及主城展示形象会同步完成更替。
主公性别转换有着清晰的操作路径，在主城主界面点击左上角的头像图标，打开个人信息面板，在面板内找到性别转换的功能按键，选定目标性别之后，消耗对应的转换道具就能完成切换。转换道具可以通过限时活动兑换、商城直购以及赛季福利宝箱获取，新手玩家开局能够领取一次免费的转换机会，后续想要再次切换就需要筹备足量的游戏道具。主公等级达到四十级才能够解锁这项功能，低等级账号无法打开性别切换的入口，玩家可以优先推进主线副本，快速提升等级解锁外观类的全部玩法。
性别切换完成之后还有不少配套的外观玩法可以搭配，主公的时装衣柜会同步开放对应性别的外观藏品，男装与女装的外观互不互通，更换性别之后原本存放的时装不会消失，只会进入对应性别的时装栏当中。玩家可以提前积攒时装碎片，男女两套外观都可以自由收集，主城庭院、军团议事、跨服对战当中都会展示最新的主公性别形象。化身符玩法能够同步更换主公的武将化身形象，化身外观同样跟随主公性别进行适配，搭配神兵幻化可以打造出风格完全不一样的主公造型。
很多玩家容易混淆主公性别调整与武将外观改造，游戏内部不存在任何道具能够改动名将的性别，武将的原画、觉醒立绘、合击动画全部锁定原有性别设定。武将的形象更换只局限于各类传说皮肤，皮肤只会优化武将的服饰特效，武将的人物性别、人物立绘基础框架不会产生任何变动。武将升星、养成、金将化育的全部养成内容，都不会触发性别相关的变化，想要调整武将外观只能在皮肤系统当中完成切换。军团分红、三国演武、赤壁鏖战等各类玩法的出战形象，依旧保持武将原本的性别设定。
主公性别转换拥有冷却机制，连续多次切换性别会产生冷却时长，玩家在操作之前可以先预览男女两款主公的模型动作与专属台词，确认好选择之后再提交转换。切换性别不会改变主公的武将羁绊效果，阵容搭配、战法搭配、战魂养成全部不受性别变动的影响，跨服竞技当中的战力排名、武将站位也不会出现变动。日常养成当中的宠物坐骑、战马外观可以自由穿戴，坐骑外观不会受到主公性别约束，男女主公都能够使用全部坐骑外观，极大拓宽了主公的穿搭搭配空间。
